WB實(shí)驗(yàn)中蛋白質(zhì)的樣品制備和蛋白質(zhì)定量,你了解多少?
南京信帆生物提供 western blot實(shí)驗(yàn)代測服務(wù)!
western blot實(shí)驗(yàn)很常規(guī),但是對于初學(xué)者來說蛋白質(zhì)樣品的制備和定量是非常關(guān)鍵的,但是你又了解多少呢?讓我們跟著南京信帆生物的技術(shù)來揭開它神秘的面紗,讓我們都清楚的了解和掌握它吧!
一、蛋白質(zhì)的樣品制備:
由于這一步方法各異,具體步驟請參考試劑盒的說明書即可。蛋白質(zhì)的樣品制備是Western Blotting的*步,樣品制備是關(guān)鍵步驟,要求盡可能的獲得所有蛋白質(zhì),應(yīng)注意以下問題:
> 在合適的鹽濃度下,應(yīng)保持蛋白質(zhì)的大溶解性和可重復(fù)性。
> 選擇合適的表面活性劑和還原劑,破壞所有非共價(jià)結(jié)合的蛋白質(zhì)復(fù)合物和共價(jià)鍵二硫鍵,使其形成一個(gè)各自多肽的溶液。盡量去除核酸,多糖,脂類等干擾分子。
> 防止蛋白質(zhì)在樣品處理過程中的人為的修飾,制備過程應(yīng)在低溫下進(jìn)行,以避免細(xì)胞破碎釋放出的各種酶類的修飾(加入合適的蛋白酶抑制劑)。
> 樣品建議分裝成合適的量(比如分裝出20ul檢測蛋白質(zhì)定量用),然后保存與-20°或-80℃中*保存,但要注意不要反復(fù)凍融,因?yàn)闀?huì)使蛋白的抗原特性發(fā)生改變。
> 若蛋白提取過程存在問題或蛋白發(fā)生降解則很難進(jìn)行好之后的實(shí)驗(yàn),也就很難做出好的結(jié)果了。除此之外 loading buffer的作用也不容忽視,切莫使用不新鮮的上樣緩沖液,同時(shí)在處理時(shí)也應(yīng)注意將樣品與loading buffer混合均勻。
二、蛋白質(zhì)定量
如果要定量的話,一般選擇BCA或者Bradford方法,BCA要求檢測波長為562nm,Bradford為595nm。具體方法見各試劑盒說明書。為避免假陽性結(jié)果,建議先把lysis buffer加入BCA工作液或考馬G250混合看是否產(chǎn)生顏色。測完蛋白含量后,計(jì)算含50~100ug蛋白的溶液體積即為上樣量(一般8cm寬的迷你膠每個(gè)泳道大能承載的蛋白質(zhì)量為150ug,所以如果從組織提取蛋白的話上樣量不宜過大)。
網(wǎng)上有人喜歡等質(zhì)量上樣(即每個(gè)泳道的上樣體積不一但質(zhì)量一定),也有使用等體積上樣(即先把各個(gè)樣品稀釋到某一固定濃度,然后等體積等質(zhì)量上樣,計(jì)算上樣體積時(shí)需包含loading buffer的體積)。按分子克隆的說法,還是使用等體積上樣比較好。
上樣總體積一般不超過15ul,加樣孔的大限度可加20ul樣品。上樣前要將樣品置于燒杯內(nèi),將燒杯置于石棉網(wǎng)上用酒精燈加熱至沸騰,在沸水中煮3~5min使蛋白充分變性。也可以使用PCR儀95°加熱5min,效果佳,操作方便。之后樣品可以在4℃冰箱短時(shí)間保存,也可在-20°冰箱保存數(shù)月,但是反復(fù)凍融會(huì)使蛋白質(zhì)的抗原特性改變。
通過上面的介紹,是不是對于WB實(shí)驗(yàn)中蛋白質(zhì)的樣品制備和蛋白質(zhì)定量,你有了更深一步的了解呢?希望在接下來的實(shí)驗(yàn)中,大家都可以一切順利,做出漂亮的實(shí)驗(yàn)結(jié)果和實(shí)驗(yàn)圖片!
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